Pozsony Városi Múzeuma napjainkban tizenegy tematikus múzeumot kínál megtekintésre, amelyek ritka történelmi műemléképületekben találhatók.

Pozsony Városi Múzeuma felügyelete alá tartozó múzeumok:

Városi Történeti Múzeum - Óvárosháza
Szőlészeti-borászati Múzeum és Korabeli Enteriőrök Múzeuma - Apponyi-palota
Fegyvermúzeum - Mihály-torony
Gyógyszerészeti Múzeum - Vörös Rák gyógyszertár
Óramúzeum - Jó Pásztor háza
Johann Nepomuk Hummel Múzeum
Arthur Fleischmann Múzeum
Janko Jesenský Múzeum 
Dévény vára
Oroszvári Antik Gerulata (Rusovce)

Forrás: Múzeum mesta Bratislavy