Das Museum wurde vom örtlichen Arzt, Patriot und Liebhaber slowakischer Volkskunst, Dr. Pavol Blaho, gegründet. Er machte am 30. September und 1. Oktober 1905 seine Sammlung von Kunst- und Volkskunstwerken und historischen Gegenständen zugänglich für die Öffentlichkeit, mit dem Ziel der Steigerung des Selbstbewusstseins der Landwirte und der Handwerker und Unterstützung der Vereinigung der Nation.
Als ein Stadtmuseum wurde es 1945, als das Volkskundemuseum für den Bezirk in 1952 registriert und seit 1965 ist es als das Záhorie Museum mit den Schwerpunkten Wissenschaft, Forschung, Sammeln, Kultur und Erziehung tätig.
Das Museum betreibt Wissenschafts- und Forschungsarbeiten auf dem Gebiet derArchäologie, Geschichte, Ethnologie,Geschichte der Musikkultur und der Volkskunst, baut Sammlungsbestande zur Archäologie, zur alten und jungen Geschichte, Numismatik, Ethnologie, Geschichte der Musikkultur und der Volkskunst, zu Postkarten, zur Fotodokumentation, Filmdokumentation, zu handgeschriebenen Schriftstücken und zur Museumsbibliothek auf.
Zum Anlass von hundert Jahren des Bestehens des Museums wurde in 2005 die Dauerausstellung im ursprünglichen Gebäude neu installiert. Präsentiert wird ein Teil der ursprünglichen Sammlung des Museumsgründers, im zweiten Teil können die Besucher mittels Sammlungsgegenstände, Fotodokumentation oder Texte die bisherigen Ergebnisse der Suche und des Sammelns auf dem Gebiet der Archäologie, Geschichte, Literaturgeschichte, Volkskunde und Volkskunst nachvollziehen. Ein Teil der Räumlichkeiten ist den mit der Stadt Skalica zusammenhängenden Werken des Landschaftenmalers Július Koreszka gewidmet.
Vorgelagerte Ausstellungen des Museums befinden sich im Nationaldenkmal St. Juraj Rotunde in Skalica, im Ján Hollý Geburtshaus in Borský Mikuláš, im Jozef Miloslav Hurban Gedenkzimmer in Hlboké und in der Habaner Mühle in Veľké Leváre. Im Hauptgebäude des Museumssitzes, dem sog. Mitták Haus werden in Abständen von einem oder zwei Monaten Museumsausstellungen und Ausstellungen bildender Kunst veranstaltet.
Alle zwei Monate erlässt das Museum die Volkskundezeitschrift Záhorie, Ausstellungskataloge und Monografien. Es veranstaltet wissenschaftliche Konferenzen, Fachseminare, Vorträge und kulturell-gesellschaftliche Veranstaltungen.
Dauerausstellung des Záhorie Museums:
Ethnologische Abteilung
Archäologische Abteilung
Historische Abteilung
Július Koreszka Galerie
Vorgelagerte Ausstellungen des Záhorie Museums:
Ján Hollý Geburtshaus in Borský Mikuláš
Jozef Miloslav Hurban Gedenkzimmer in Hlboké
St. Juraj Rotunde in Skalica
Huttererhaus in Veľké Leváre
Quelle: Záhorské múzeum Skalica